Растительный и животный мир Кыргызстана богат разнообразием видов и определяется в зависимости от высотной поясности. Страна расположена в умеренных и субтропических широтах, богата высокими горами и обширными долинами. На территории республики встречаются пустыни, полупустыни, степи, луга, леса, кустарники, болота, горные тундры. В северной части страны чаще встречаются степи, луговые степи, луга, кустарники и леса. На юге, из-за сухого климата более распространены полупустыни и пустыни. 

В Кыргызстане насчитывается более 500 видов позвоночных животных, около 50 видов рыб, 4 вида земноводных, 28 пресмыкающихся, около 350 птиц, 86 млекопитающих, около 30 тысяч видов простейших и беспозвоночных и более 1600 видов полезных дикорастущих флор, из которых более 200 видов это лекарственные растения.

Среди диких растений можно отметить: солончак, барбарис, ревень, Ферганский молочай, разные виды чабреца. К лекарственным видам относится: василистник, Каракольский аконит, древясил, туркестанский пустырник, зверобой, мать-и-мачеха, душица, облепиха и т.д. В лесах растут тюльпаны и эдельвейсы, а также пихта Шренка, сибирская пихта и можжевельник. Наиболее распространенные деревья: ели, можжевельник (арча), везде растут ель, клен, тополь, ива, березовые леса и Тянь-Шаньские рябины. Летом с долины открывается прекрасный вид на поле, усыпанное маками. В лесах, степях и лугах можно найти много различных видов грибов. Юг страны славится самым большим в мире естественным ореховым лесом. По всей территории республике широко распространены заросли таволги, шиповника, облепихи, алычи, жимолости, барбариса, на юге республики добавляются миндаль, фисташка и пр.

Господствующими в растительном покрове пустынь являются солянка, верблюжья колючка, татарник, полыни. В долинах среди обилия злаков (мятлики, ежа, костер, заячий ячмень) значительное участие в травостое принимают эфемеры и эфемероиды (маки, тюльпаны, подснежники, крокусы). В степной зоне преобладают типчак, овсяницы, ковыль, чий, полыни, эфемеры, зизифора, чабрец, шалфей, герань холмовая, тысячелистник, змееголовник, василистник, пырей, карандыз, эремурусы, ферулы, бородач. На пойменно-долинных лугах господствуют осока, тростник, рогоза, островки болотной растительности. Горные тундры образуют лишайники, мхи, криофитные злаки, осоки, подушечники и разнотравье.

На территории Кыргызстана встречаются более редкие виды животных, обитающие в горах, такие как баран Марко Поло, олени, рыси и снежный барс. Красная книга республики включает десятки видов животных: снежного барса, среднеазиатскую выдру, марала, тяньшанского бурого медведя, горного барана (архара), беркута.

Для пойменных и приозерных зарослей характерны серая цапля, волчок, выпь, фазан, коростель, иволга, пеночки, сорокопуты, мухоловки, соловьи. Из млекопитающих — ушан, лесная соня, ласка, камышовый кот, кабан. На высоте 3400 и 3800 м обитают серые сурки, серебряные горные полевки, коричневые медведи, дикие бараны, зайцы и горные козы. Выше снежной линии, на высоте свыше 4000 м встречаются красногрудая горихвостка, альпийский горный зяблик, горный гусь, сизый голубь, куропатка, альпийская галка и большие снегиря. А на высоте в 4500 метром обитают снежные козы и хищные леопарды.

Среди птиц Кыргызстана встречаются: кулики, горный или индийский гусь, чайки, крачки, поганки, серая цапля, зимородок, черный аист, журавль-красавка, лысухи, нырки, лебеди и даже фламинго. В пустынной зоне обитают саджа и рябки, а также пустынный вьюрок, черная каменка, малый жаворонок, каменный воробей, скалистый поползень. В степной зоне обитают луни, сарычи, степной орел, могильник, стервятник. В еловых, арчовых и в орехоплодовых лесах обитают сизый голубь, кеклик, кукушка, скворец, удод, сорока, ворона, галка, щегол, синица, дрозд, филин, ушастая сова, черный коршун, перепелятник.

В горных озерах Кыргызстана обитает чебак, чебачок, осман, маринка, губачи, быстрянка, голец, пескарь, севанская форель, судак, лещ, сиг, карп, карась, омуль и др. В реках, а также в других водоемах республики обитают сазан, щука, усач, елец, жерех, толстолобик, змееголов, белый амур, окунь и др.